Theseus regeerde vele jaren met wijsheid en vaardigheid. Hij verenigde de verschillende hoven, gehuchten en gemeenten om de sterke stadstaat ‘Athene’ te maken. Hij creëerde een grondwet die hij zelf uitvoerde, waardoor Athene het voorbeeld werd van vele andere steden. Hij had een gelukkig huwelijk met zijn vrouw, de Amazone Hippolyte, die ook de moeder van zijn zoon ‘Hippolytos‘ is .

Hippolyte stierf echter tijdens een aanval op de Amazones, en dus ging Theseus op zoek naar een andere vrouw die hem hetzelfde geluk zou brengen. De vrouw die hij uiteindelijk vond was de zus van Ariadne, Phradra, en hun huwelijk bracht het bondgenootschap tussen Athene en Kreta tot stand. Phadra schonk hem twee zonen, maar ze hield nooit echt van hem. In feite was ze verliefd geworden op Hippolyos, de zoon van Theseus eerste huwelijk, maar het verlangen van zijn stiefmoeder maakte de jongen zo ziek dat hij haar altijd probeerde te ontwijken.

Gaandeweg kon Phadra haar verslagenheid niet meer verdragen en ze hing zich op. Theseus vond haar bij zijn terugkeer van een reis, met een brief in haar hand waarin ze zei dat ze de pesterijen van Hippolytos niet meer kon weerstaan. Hierna verbande Theseus zijn zoon uit zijn land. Spoedig kwam een oude voedster en vertelde hem de waarheid, maar het was al te laat: Hippolytos had een ongeluk gehad en was overleden.

Toen was het de koning die door de dorpelingen uit de stad werd verbannen. Hij stierf op het eiland Skyros, waar de koning ‘Lycomedes‘ hem van een klif duwde.  Het orakel van Delphi zei echter dat als ze Theseus een eervolle begrafenis gaven, Athene een glorieuze toekomst zou hebben. Daarom vertrok de Atheense ‘Kimon’ om de morele resten van Theseus te zoeken en keerde terug naar Athene met zijn lichaam om hem te begraven.